由于玻璃本身比聚乙烯薄膜价格高很多，同时玻璃的支撑紧固构件比聚乙烯薄膜的也更复杂，因此玻璃温室比聚乙烯薄膜温室造价高出许多。更多的结构材料、较高的安装精度要求以及较长的安装时间，也决定了建造玻璃温室的整个投资较高。例如，与聚乙烯薄膜温室相比，文洛型玻璃温室的投资大约为2倍，圆弧形玻璃温室是2.5倍，大跨度玻璃温室达2.5～3倍。

 

　　在某些特定场合下，按照法规要求必须使用诸如钢化玻璃或安全玻璃等特殊玻璃。有公众出入的商业零售型温室就是非常普遍采用这种特殊玻璃，特殊玻璃的要求更加增加了温室建造费用。

 

　　由于玻璃的热阻较小，玻璃温室加热需要能耗，因此玻璃温室的运行费用也比双层聚乙烯薄膜温室或双层聚碳酸酯板温室高。但是，玻璃自身的一些优点以及通过其他一些手段，例如冬季玻璃温室内更充足的光照、使用节能保温幕等方法，来弥补运行费用的差别。